明代中医也有所发展，除了中医药方面，大家都知道，中医外科著作出现了不少了。
《外科枢要》薛己撰，为瘡傷证治专书，以外科病症为纲，讲全身瘡傷分为30余种，并对筋瘤、血瘤、肉瘤、气瘤和骨瘤作了描述。
《伤医证治准绳》王肯堂撰，对外科病症诊治有丰富的论述，提出骨伤科医生了解骨骼知识的重要性，记载了多种外科手术的方法。其中有些是中医外科史上的较早记载，如气管吻合术，耳廓外伤整形术，此外，还记载了唇、舌外伤后的整形术，以及头颅，肩胛、颈部、胸腹、腰、臀、脊柱等外伤的急救手术与药物。
《外科正宗》撰著者陈宝功（1555-1636年），崇川（今江苏南通）人。《外科正宗》主要是他对医学理论与经验的总结。他认为“内之证或不及于其外，外之证则必根于其内也”，因此，对外科疾病，他也很重视调理脾胃，主张多采用托、補二法。他记载了鼻息肉摘除术、咽喉食道内的铁针取出术及截肢术等，设计制造了摘除鼻息肉的手术用具，介绍了枯痔散、枯痔钉、掛线等治疗痔瘺的方法。《外科正宗》对皮肤病也有不少记载，奶藓最早见于此书。该书还记载了多种肿瘤，最早详记粉瘤、发瘤与失荣。
明代的女科《女科证治准绳》，幼科《保婴撮要》、《幼科证治准绳》等，还有不少痘疹方面的著述，麻疹病名出现也是在此时期。
五官科明代眼科专书《審視瑤函》，又名《眼科大全》，傅仁字编撰，書中记载了三百余首方剂及用药宜忌，分述金针撥障術，以及针、割、烙、点、洗、敷、吹等眼科外治法，并对煮针法、术前洗眼、手术方法与术后护理作了介绍，对小儿目疾与眼科针灸有所论及。书中还绘图说明多种眼科手术器械及眼科针灸要穴。
针灸书籍也大量出现，推拿按摩的书籍出现，以“推拿”名称代表按摩术，不仅成人使用，而且推广到小儿多种疾病的治疗。
