太平天国夺去满清半壁江山，清廷对太平天国恨之入骨。天国被剿灭之后，所获战俘不分首从，一律处以极刑。清廷处死太平天国战俘的极刑主要有凌迟、剖腹、摘心、剥皮等，法场上血肉横飞，惨绝人寰。
一、凌迟枭首极刑
太平军战俘除了投降和遣散的，大小首领多处以凌迟枭首极刑。1851年10月3日，钦差大臣赛尚阿奏报，“长发逆匪沈承章”在广西藤县华锦村被即凌迟处死。12月12日，何名科在广西贵县郭南里地方被凌迟处死。1852年1月14日，湖南宜章县义军女将王萧氏被凌迟处死，后又“剉尸戳尸”枭示。1853年11月，福建小刀会首领黄德美、黄光著、黄光扬在厦门被“凌迟斩枭”。1853年12月3日，上海小刀会首领李咸池在福建龙溪县石码镇被凌迟处死，传首示众。被处以凌迟枭首极刑的还有太平军密探僧人宝战龙、饶阳县唱戏人王沛山、新乐县回民马二雪……
凌迟太平军战俘，僧格林沁最狠，太平军投降也不饶。1855年2月18日，四川人萧风山、安徽人钟有年带领水手91人出降。僧格林沁传令，除年老和15岁以下孩子不杀外，萧风山凌迟，其余斩首。1855年3月11日，僧格林沁用30余名太平军战俘祭飨阵亡将士。
在清军围剿太平军过程中，被俘的太平军大多难逃凌迟之刑，或脔于市，或凌迟祭旗。有时，太平军战俘被集体凌迟处死，少则几人，多则一百多人。1856年9月18日，江南提督和春、都统麟瑞攻陷安徽庐江县后，一次就凌迟180多名太平天国战俘，刑场上血肉横飞，惨不忍睹。
二、摘心活祭极刑
清廷抓到太平天国战俘后，为解心头之恨，还摘心活祭，以慰阵亡将士在天之灵。从1851年到1858年，被清廷摘心活祭的太平天国战俘有黄亚陈、汤亚才、雷亚书、罗五、江华国、余光政、刘仁有、李新三、孙德明、杨晋龙、石仁沅、王小勇、高刚头、李春方、赖元益等。使用摘心活祭极刑最狠的还是僧格林沁，他曾将80多名太平军战俘摘心，供案祭奠在连镇、高唐、冯官屯三地阵亡的8000余名官兵，还作祭文高声朗诵：“渠魁既歼，贼党悉擒。剖其心肝，慰尔忠魂。”听罢此文，清军皆恸，而惨死的太平军战俘却无人理会。
三、剥皮剖腹极刑
剥皮部腹为法外之刑，僧格林沁却大胆地用在了太平军战俘身上。围困连镇时，太平军有被俘者，僧格林沁传令全部“剖视肠腹”。1855年1月17日，僧格林沁将两名太平军战俘扒皮处死。1857年1月30日，湘军知府吴坤修攻陷江西奉新县，将221名太平军战俘全部扒皮剖腹处死。《曾国藩奏折》：“生擒老贼二百二十一名。每生擒一贼，辄剖肠，剥皮挂树，磔石，见者无不凛凛”。同时将200多人扒皮，可谓今古奇观。
四、太平天国高级将领的悲惨下场
太平天国被剿灭后，高级将领几乎无人善终。洪大全在北京被凌迟，还瞪着眼睛看着刽子手割他肉。林凤祥也在北京菜市口被凌迟，行刑的刽子有16人，到死他都没呼一声。李开芳在北京被凌迟。刘玱琳被湘军肢解，割头示从。石镇吉在桂林府被凌迟处死。陈朝旺在庐州府被凌迟处死，枭首示众。英王陈玉成在河南延津西教场被凌迟处死，年仅26岁。沃王张乐行在安徽亳州义门集之周家营被处以磔刑。潮王黄子隆在无锡被凌迟处死，悬首示众。护王陈坤书被凌迟处死，枭示常州东门外，首级竿示。忠王李秀成在南京被凌迟处死，首级传示被扰地方。祜王蓝成春被僧格林沁极刑处死，“寸磔其身，血尽而黄水出。”干王洪仁玕在南昌被处以凌迟死刑。森王侯玉田在广州府被凌迟处死。侍王李世贤在福建漳州府被处以凌迟极刑。总统天将胡永祥在广东嘉应州被凌迟处死。偕王谭体元被处以凌迟死刑，枭首嘉应州城外。遵王赖文光在扬州被“凌迟处死，传首以徇。”翼王石达开在成都府北校场被凌迟极刑处死，死后清军啖其肉，在太平天国将领中死得最为悲壮。
